Происходил из мелкопоместного дворянства Полтавской губернии.
Отец Драгоманова в молодости жил в Петербурге и сотрудничал с русскими альманахами 1820—1830-х гг., на родине собирал украинские песни и писал по-украински.
Украинская среда дома, в Гадяче, и в Полтаве, где Драгоманов учился в гимназии, повлияла на его дальнейшее развитие. Ещё в гимназии он, под влиянием своего учителя Стронина, увлекался изучением истории.
В 1863 году окончил Киевский университет Св. Владимира.
Работал учителем географии во Второй киевской гимназии.
В 1865 году принят на должность приват-доцента на кафедру всеобщей истории историко-филологического факультета Киевского университета Св. Владимира.
Читал лекции по истории Древнего Востока, истории и историографии Древней Греции, истории Древнего Рима, Новой истории эпохи Реформации и Возрождения.
Опубликовал ряд статей по древней истории.
В 1870 году защитил магистерскую диссертацию на степень магистра всеобщей истории на тему «Вопросы об историческом значении Римской империи и Тацит».
После научной командировки за границу в 1873 году назначен на должность штатного доцента.
В 1875 году уволен из университета как политически неблагонадежный.
В 1876 году эмигрировал за границу, до 1889 года жил в Женеве (Швейцария), с 1889 года — профессор Софийского университета (Болгария).
Михаил Драгоманов — автор работ:
«Шевченко, українофіли і соціалізм» (1879);
«Историческая Польша и великорусская демократия» (1883);
«Чудацькі думки про українську національну справу» (1891);
«Листи на Наддніпрянську Україну» (1893);
«Автобіографічної замітки» (1883) и «Добавлення» к ним (1889);
Мемуаров «Австро-руські спомини. 1867—1877» (1889—1892);
«Исторические песни малорусского народа» (1874—1875, в соавторстве с В. Антоновичем);
«Малорусские народныя предания и рассказы» (1876);
«Нові українські пісні про громадські справи: 1764—1880» (1881);
«Політичні пісні українського народу XVIII—XIX ст.» (1883—1885) и др.
Умер 2 июля 1895 года (20 июня по ст. ст.) в Софии.
В 1989 года в Киеве именем ученого названа улица.
Национальному педагогическому университету присвоено имя М.П. Драгоманова.
6 Мая 2002 года перед университетом (улица Николая Пирогова, 9) открыт памятник-бюст М.П. Драгоманову. скульптор, доцент университета Александр Красноголовцев, архитектор — Степан Слипец.
Памятник М.П. Драгоманову в Киеве
Википедия (укр.)
Украинский центр
Кабинет-музей М.П. Драгоманова