В 1897 году окончил Военно-медицинскую академию в Санкт-Петербурге.
С 1898 по 1902 год — военный врач.
В 1903—1909 годах преподавал физиологию и проводил исследования в лаборатории И.П. Павлова.
В 1909—1910 гг. — профессор Харьковского университета.
С 1910 по 1921 год — заведующий кафедрой физиологии медицинского факультета Киевского университета, в 1921—1935 гг. — заведующий кафедрой Киевского медицинского института, с 1936 по 1941 год — заведующий кафедрой 2-го Киевского медицинского института.
Научные работы ученого посвящены вопросам применения теории электролитической диссоциации, предложенной С. Аррениусом, выявлению физико-химического характера электрических потенциалов в живых тканях и механизма их электрического раздражения.
Предложил первую ионную теорию биоэлектрических явлений. Экспериментально обосновал теорию раздражающего действия электрического тока.
Василий Чаговец был инициатором изготовления отечественной электрофизиологической аппаратуры.
Умер 19 мая 1941 года в Киеве, похоронен на Лукьяновском кладбище.
Сын — биохимик, академик АН УССР Ростислав Чаговец.
Википедия (укр.)
Ю.І. КУНДІЄВ «ОСНОВОПОЛОЖНИК СУЧАСНОЇ ЕЛЕКТРОФІЗІОЛОГІЇ» (.pdf)
Л.О. Клименко «ЧАГОВЕЦЬ ВАСИЛЬ ЮРІЙОВИЧ – ЗАСНОВНИК ЕЛЕКТРОФІЗІОЛОГІЧНИХ ДОСЛІДЖЕНЬ В УКРАЇНІ» (.pdf)