Начальное образование получил дома, учился в Саратовской гимназии.
В 1874 году поступил в Медико-хирургическую академии, где преимущественно занимался химией в лаборатории А.П. Бородина.
В 1878 году перевелся в Московский университет, где под влиянием лекций К.А. Тимирязева и В.Я. Цингера начал изучать ботанику после курса химии.
После окончания Московского университета (1881) преподавал в нем, позднее в Петровской сельскохозяйственной академии и Петербургском университете.
В 1894 году приглашен работать на кафедру систематики и морфологии растений Киевского университета.
Читал курс анатомии, морфологии и систематике растений.
Участвовал в строительстве школы в районе Святошино под Киевом, много времени проводил с детьми, занимался делами Киевского общества естествоиспытателей.
В 1898 году выступил с докладом об исследовании двойного оплодотворения у Lilium martagon L на заседании Х съезда естествоиспытателей и врачей. В том же году работал на острове Ява (Индонезия).
В Киеве ученый создал отечественную школу цитологии и эмбриологии растений.
В 1894—1914 гг. был директором ботанического сада Киевского университета.
Сергей Навашин работал преимущественно в области химии, а также цитологии, эмбриологии и морфологии растений. Исследовал у березы механизм проникновения пыльцевой трубки в семенную почку через ее основание — халазы; прохождения трубки в ольхе, вязе, грецком орехе и впоследствии доказал наличие халазогамии и в других однопокровных растений. Фундаментальное значение имело открытие им у покрытосеменных растений двойного оплодотворения, пояснил природу их триплоидному эндосперма, а также природу ксений.
В 1918—1923 гг. — профессор Тбилисского университета.
Один из основателей (1923) и первый директор (до 1929) Биологического института имени Тимирязева в Москве.
С 1929 года — заведующий Цитологической лаборатории АН СССР в Детском Селе (бывшее Царское Село), ныне город Пушкин Ленинградской области.
Умер 10 декабря 1930 года в Детском Селе. Похоронен в Москве.
Википедия (укр.)
Сайт Who-Is-Who.ua
SERGEI GAVRILOVICH NAVASHIN (eng.)